Πηγή από το Υπουργείο Αμυνας επικαλείται η βρετανική Express που αναφέρει ότι βρίσκεται σε εξέλιξη έρευνα σχετικά με σήμα πλοιάρχου εμπορικού πλοίου που ανέφερε μια "φλόγα στον ουρανό" περί τα 130 ναυτικά μίλια νότια της Καρπάθου.
Εμπειρογνώμονες αεροπορίας αναφέρουν πως στις 04:26 ελήφθη ένα σήμα κινδύνου που θα μπορούσε να είχε σταλεί από το αεροσκάφος μέσω συστήματος έκτακτης ανάγκης. Ωστόσο ο αιγυπτιακός στρατός διέψευσε ότι το Airbus εξέπεμψε σήμα κινδύνου.
Ο Ahmed Adel, αντιπρόεδρος της EgyptAir's δήλωσε στοd CNN πως το αεροσκάφος δεν έχει κανένα παολύτως πρόβλημα ούτε όταν έφθασε στο Παρίσι ούτε όταν αναχώρησε για το Κάιρο.
Επιπλέον σημειώνει πως δεν υπήρχε ειδικό φορτίο στο αεροπλάνο ούτε ο κυβερνήτης είχε ενημερώσει για την ύπαρξη επικίνδυνων υλικών.
Το σκάφος χάθηκε από τα ραντάρ 30-40 μίλια βόρεια της αιγυπτιακής ακτογραμμής στα Σύνορα Πληροφοριών Πτήσεων Ελλάδας - Αιγύπτου.